2014年9月，中国药科大学优化学科布局、完善学科生态群，整合分散于药学院、生命科学与技术学院、理学院的工学相关学科，成立工学院。学院以工程技术为支撑、教学科研型学院为发展定位，围绕药物研发各环节、交叉融合特色鲜明，努力向“小而精”方向发展，“小”即重点发展，“精”即高水平建设。

学院现有教职工114人（专任教师81人、博士后10人），在读学生1331人（本科948人、硕士325人、博士58人），下设制药与环境工程系、食品营养与安全系、生物医学工程与诊断药学系和GMP实训中心。专任教师中，正高级职称15人，副高级职称45人，博士生、硕士生导师48人。学院教师通过整合科研资源，凝练科研万向，不断进取创新，近五年成功获批教育部智能制药工程研究中心、国家重点研发计划、国家自然基金重大国际（地区）合作基金、国家自然基金重点项目、国家重大科研仪器研制项目、海外及港澳学者合作研究基金、国家自然基金优秀青年基金、江苏省杰出青年科学基金等项目。

学院目前设有3个本科专业：制药工程、食品营养与健康（食品质量与安全）、环境科学。现有药学（制药工程学）药学类二级学科博士学位、硕士学位授权点，生物医学工程一级学科硕士学位授权点，制药工程、生物与医药专业学位授权点。

学院建有符合新版《药品质量管理规范》（GMP）的实训中心，为省级学科综合训练中心，运行固体制剂、注射剂、冻干粉针、生物制药、中药提取、药物合成和公用工程等七个车间（生产线），总建筑面积达4800平方米，其中净化面积3600平方米，是集规模化、系统化、信息化于一体的实践教学及工艺优化平台。

学院科研氛围浓厚，建有生物检测实验平台、化学合成实验平台，制药工程实验中心、分子生物学实验中心、微生物实验中心、分离纯化技术实验中心、色谱仪器实验中心、药物分子影像中心等；学院拥用先进的仪器设备，包括小动物核素SPECT/CT成像系统、生物透射电镜TEM等大型仪器，为学院的教学、科研提供了有力的支持。

学院发展定位：以工程技术为支撑、服务于医药发展、学科交叉融合、药学特色鲜明的高水平工学院。学院将利用学校药学学科优势，开拓创新，围绕药物研发各环节，在学科内涵和平台建设、人才培养与教学设计、科研氛围营造与方向凝练、师资队伍整合和人才引进等方面积极创新。